In Japan sind zwischen 4'000 und 6'000 Pflanzenarten beheimatet. Einige Pflanzen haben sogar eine symbolische Bedeutung. Kirschblüten zum Beispiel symbolisieren die schnell vergängliche Schönheit und Pinien bdeuten ein langes Leben.
In der japanischen Küche werden nicht nur Früchte und Getreide verwendet, sondern auch einige Arten von Blumen und Blättern. Pflanzen spielen auch eine Rolle in der Blumensteckkunst, in der Malerei, Weberei, Keramik und bei Lackwaren. Die Japaner stellen auch Medizin, Farben, Kleidung, Papier und Werkzeuge aus Pflanzen her.
Japan hat eine einmalige Tierwelt. Einige Arten von Spechten, Fasanen, Libellen, Krabben, Haien, Schlangen, Salamandern und Meeressäugetieren gibt es nirgendwo sonst auf der Welt. Trotz dieser Vielfalt gibt es in Japan nur 118 Arten wilder Säugetiere, die meisten davon sind kleine Nagetiere. Jedoch gibt es auch Bären, Hirsche, Wildschweinchen, Flughörnchen, Fledermäuse, Affen und eine Art Waschbär, "Japanischer Dachs" genannt. Obwohl die Japaner seit jeher Vorurteile gegen einige Tiere haben, sind sie im allgemeinen sehr naturverbunden

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